Після експедиції на планету Абидос (фільм зіркові ворота ) І знищення Ра і його солдат полковник Джек О'Нілл вийшов у відставку.

Пройшов рік. Військові заховали Зоряні Врата глибоко під землею, на секретній базі Шаенского гірського комплексу. Цілий рік Зоряні Врата не діяли, охорона - п'ять офіцерів військово-повітряних сил - в посадковому ангарі безтурботно коротають час за грою в покер. Раптово ангар затремтів, шеврони на Вратах спалахнули червоними вогнями. Гравці в жаху схопилися зі своїх місць і кинулися за зброєю. Над пандусом пронісся енергетичний вихор - відкрився просторовий тунель. В ангар увірвалися одягнений в золоті обладунки Апофіс і Тіл'к з загоном Джаффа в уніформі Воїнів Змії. Пострілами з енергетичних жердин вони перебили охорону, а жінку-офіцера, безвольну, оглушену наручним пристроєм Апофіса, Тіл'к поцупив за Врата перш, ніж встиг з підмогою генерал Хеммонд , Якого Апофіс на прощання удостоїв золотим поглядом.

А генерал Хеммонд залишився стояти посеред залитого кров'ю ангара, в шоці дивлячись крізь спорожнілі Врата. Прийшовши до тями, він наказав своєму помічникові, майору Самуельсен, доставити на базу полковника О'Нілла. Відставний полковник на даху будинку розглядав в телескоп нову Галактику і з небажанням погодився поїхати на базу.

Генерал Хеммонд провів О'Нілла в лабораторію і показав тіло вбитого під час битви Джаффа і його енергетичний жердину, який Джек, на подив Хеммонд і Самуельса, досить спритно включив.

Коли О'Нілл повернувся з лабораторії в офіс генерала Хеммонд, то з подивом помітив у кімнаті для брифінгу Кавальского і Ферретті - його колишніх підлеглих, які брали участь в експедиції на Абидос. Хеммонд все допитувався у Джека, що сталося на Абидосе, про істот з світяться очі, про археолога Даніеле Джексона . Але Джек ухилився від прямої відповіді, сказавши, що все описав у рапорті, і, що Ра - єдине на світі істота з палаючими очима - загинув на Абидосе від вибуху ядерної бомби.

Тоді Хеммонд привів Джека в посадковий ангар і показав стоїть на пандусі ядерну бомбу. Технік встановив таймер. Джек виявився в пастці. З одного боку, за липовий рапорт йому загрожує військовий трибунал. З іншого боку, ще одна ядерна бомба погубить тисячі невинних життів. І він зізнався, що порушив наказ і підірвав бомбу нема на планеті, а на космічному кораблі Ра, що Зоряні Врата на Абидосе незнищенні, і, що Даніел Джексон залишився жити серед місцевих жителів. Генерал Хеммонд із задоволенням вислухав визнання Джека, і ... віддав наказ технікам готувати бомбу до відправки на Абидос, а Джека під конвоєм відправив в ізолятор до Кавальскому.

Не встигли О'Нілл і Кавальскій обмінятися привітаннями, як двері ізолятора відкрилася, впускаючи генерала Хеммонд.

Хеммонд: Скільки людей, по-вашому, ви бачили на Абидосе?

О'Нілл: Ми бачили близько п'яти тисяч. Значить, ви переглянули питання про відправку бомби?

Хеммонд: Це означає, я відкритий для пропозицій.

О'Нілл разом з Кавальскім переконали генерала Хеммонд замість бомби послати на Абидос звісточку Даніелу Джексону. Щоб попередити Даніела про нову експедиції, спритний О'Нілл відправив через Зоряні Врата упаковку паперових носових хусток (з натяком на алергію Даніела) ...

Самуельсен: А якщо вони потрапили до прибульців?

О'Нілл: Ну, тоді вони прямо зараз витирають свої носи.

... і незабаром отримав відповідь - порожню упаковку з написом: «Спасибі, надішліть ще». Прочитавши послання від Даніела, Хеммонд призначив на 8.00 брифінг і оголосив О'Нілл, що його відставка закінчилася.

На брифінгу генерал Хеммонд представив нового члена загону - капітана Саманту Картер - теоретичного астрофізика, і дозволив полковнику О'Нілл повернутися на Абидос. Але, з однією умовою, якщо протягом 24 годин від його загону не зробить звісток ( «і ніяких носових хусток»), на Абидос буде надіслана бомба.

У повній екіпіровці група О'Нілла перетнула Зоряні Врата і опинилася в курній і порожній піраміді. Їм зустріли озброєні підлітки, Даніел і його дружина Кулі. Саманту заколисало під час переходу, але вона забула про нудоту, побачивши пристрій для набору координат. Кавальскій вручив Даніелу упаковку носових хусток, а О'Нілл, привітавши Скаар, розповів, чт на земну базу напало істота з світяться як у Ра очима. Даніел в подиві, адже Ра мертвий, а піраміда і Зоряні Врата Абидоса під цілодобовою охороною.

На доказ того, що Земля і Абидос не єдині планети, що мають Зоряні Врата, Даніел після вечері привів О'Нілла, Кавальского і Саманту в печеру, виявлену ним під час розкопок. На стінах печери Стародавні висікли координати безлічі планет нашої Галактики.

Тим часом, в піраміду через Врата проник Апофіс із загоном Джаффа. Зламавши опір солдатів і абідосіанскіх підлітків, Апофіс захопив в полон Кулі і Скаар. Коли О'Нілл, Кавальскій, Даніел і Саманта повернулися в піраміду, Апофіс вже зник в просторовому тунелі. Кам'яні підлогу піраміди був усіяний пораненими і убитими. Ферреті теж важко поранили, але він зумів підглянути координати, які набрав Апофіс. Вмираючий підліток сказав Даніелу, що з Зоряних Воріт з'явилося істота з світяться очі, напало на них і забрало Кулі і Скаар. Пораненим потрібна медична допомога. О'Нілл наказав своїм людям повертатися на Землю і переконав Даніела відправитися з ними ( "Ферретті можливо бачив координати"). Прощаючись з абідосіанцамі, Даніел велів їм поховати Врата, поклавши на них великий камінь, і відкрити рівно через рік, щоб він і Кулі змогли повернутися додому, а потім закрити Врата назавжди.

На базі загін О'Нілла очікував сюрприз: озброєна до зубів охорона в посадковому ангарі і титанова діафрагма в Зоряних Вратах. Поки медики оглядали поранених, О'Нілл розповів Хеммонд про напад Апофіса і викраденні Кулі і Скаар.

Джаффа замкнули полонених у величезній, освітленому факелами, старовинному замку. Разом з іншими в'язнями Кулі і Скаар залишилися чекати своєї долі. Двері темниці відчинилися, щоб впустити Тіл'к, а коли зачинилися - Скаар залишився без сестри - Джаффа за наказом Тіл'к забрали Кулі.

По дорозі додому, О'Нілл заглянув в лазарет до Ферретті, де розташувався, клюющій носом від утоми, Кавальскій, який вирішив залишитися чергувати біля ліжка одного на всю ніч. У коридорі Джек помітив що стоїть з розгубленим виглядом Даніела ( "Вони не знають, що зі мною робити, і я не знаю, що мені робити з собою") і запросив його до себе в гості. За пляшкою пива, Даніел розповів О'Нілл, як вони були щасливі з Кулю, а О'Нілл зізнався Даніелу, що ніколи не пробачить собі загибель сина ( "але іноді я забуваю, іноді").

У замку Апофіса найкрасивіших полонянок одягли в вишукані сукні та прикраси і посадили в окрему кімнату, серед них виявилися жінка-офіцер, викрадена з земної бази, і Кулі. З'явилася на порозі Тіл'к вибрав жінку-офіцера і повів її до Апофіса. Апофіс окинув оцінюючим поглядом свою майбутню королеву. Жінка Джаффа вийняла з живота личинку і піднесла до полонянки, але Гоа'улд відмовився перейти в нового господаря, і Апофіс вбив невдалого носія. Наступна претендентка - Кулі, дружина Даніела, - припала симбиот за смаком, він пронизав її шию гострими щелепами і зник в тілі жінки. Королева обрано. На обличчі Тіл'к промайнула гримаса відрази.

На брифінгу, влаштованому після повернення загону О'Нілла з Абидоса, генерал Хеммонд оголосив наказ президента, сформувати дев'ять розвідувальних загонів, полковника О'Нілла призначити командиром СГ-1, а майора Кавальского - командиром СГ-2. Ферреті прийшов до тями і пригадав координати планети, набрані Апофісом, і СГ-1 з СГ-2 відправилися за втікачем з світяться очі.

По дорозі в посадковий ангар майор Самуельс вручив полковнику О'Нілл передавач, за сигналом якого техніки на Землі відкриють діафрагму. Якщо загони втратять передавач або введуть неправильний код, діафрагма залишиться закритою, і О'Нілла і його команду чекає загибель в просторовому тунелі. На операцію командування відвело 24 години, загону О'Нілла доручили розвідувальну місію, а СГ-2 - охорону Зоряних Воріт і базового табору. Якщо СГ-1 не повернуться через добу, загону Кавальского наказано покинути табір і повернутися на Землю без СГ-1, з їх поверненням всі коди будуть анульовані, Врата блоковані, і дорога на Землю закрита. Генерал Хеммонд виголосив напутнє слово, і шестеро сміливців зробили крок в просторовий тунель.

На іншій стороні їх зустріли тиша і спокій. Зоряна брама, оточені кам'яними колонами, виглядали занедбаним. Загін Кавальского залишився в резерві ( «Якщо ми не повернемося через 20 годин ...» - О'Нілл, «Ми підемо рятувати ваші жалюгідні дупи» - Кавальскій, «Ні, ви повернетеся на Землю, щоб встигнути до закриття діафрагми»), а Про 'Нілл, Даніел і Картер вирушили на розвідку.

По дорозі Даніел (всупереч бажанню О'Нілла, який вважав за краще б приховане спостереження) розговорився з місцевими монахами. Ченці, прийнявши Джека, Даніела і Саманту за Гоа'улдов, привели їх в великий палац в стилі Стародавнього Риму, у внутрішньому дворику якого за святково накритими столом сиділи, одягнені в білі тоги, люди, всюди чути музика і сміх. Чернець посадив Джека, Даніела і Саманту за стіл. Бенкетуючі злякано втупилися на них.

КАРТЕР: Чому вони на нас так дивляться?

Даніель: Вони взяли нас за богів.

По залу прокотився низький звук ріжка, пролунали важкі кроки, все впали ниць. Даніел, Саманта, а потім, з великим небажанням, і Джек зробили те ж саме. Свято досяг кульмінації, до пірующім вийшов Апофіс зі своєю новою королевою - Кулі. Даніел метнувся до дружини ( "Кулі, це я"), жінка оглянула його байдужим поглядом. Апофіс включив наручні пристрій і відкинув Даніела. Даніел врізався об стіну і, оглушений, звалився на підлогу. О'Нілл скинув гвинтівку і прицілився в Апофіса, але Кулі закрила Гоа'улда своїм тілом. О'Нілл опустив зброю, і тут же отримав удар по голові від Воїна Змії.

Коли до завершення місії залишилося менше двох годин, генерал Хеммонд викликав Самуельса: «Ми зможемо отримувати повідомлення від наших команд після закриття діафрагми?», «Так, сер. Але як ми переконаємося, що це не опинитися чужаки або один з наших людей, якого змусили під тортурами. Кращий вихід - запечатати Зоряні Врата ».

Джек, Даніел і Саманта після сутички з Апофісом опинилися у в'язниці. Даніел, що пролежав кілька годин без свідомості, прийшов в себе. О'Нілл під час обходу темниці зустрів Скаар. До закриття діафрагми залишилося півтори години. Несподівано один з Воїнів Змії схопив О'Нілла за зап'ястя, увагу Тіл'к залучили земні години полковника. Він поцікавився, з якої планети прибутку бранці. Даніел намалював на підлозі символ Землі - маленький трикутник з кружечком зверху. Тіл'к подивився на малюнок, а потім швидко стер кінчиком жердини.

Ніч в таборі пройшла спокійно, вранці піднявся холодний вітер і замрячив дощ. Час, відведений на місію, майже минув. Кавальскій, незважаючи на ризик застрягти на Чулаки, вирішив дочекатися полковника О'Нілла.

О'Нілл, сподіваючись знайти вразливе місце, забрався по стіні до вузького віконця, смикнув за ґрати, вона не піддалася. Він зістрибнув вниз до очікуваних його Скаар і продовжив огляд периметра темниці. Даніел і Саманта влаштувалися неподалік, намагаючись відгадати, хто їх ворог? Нарешті, Даніел здогадався, що це Апофіс - давньоєгипетський бог змій. Апофіс правил вночі, а Ра царював днем.

Двері в темницю знову відкрилася, і на порозі з'явився Тіл'к з загоном Воїнів Змії. За його сигналом Джаффа внесли позолочений паланкін, з якого вийшли Апофіс із Кулі. Скаар пояснив Джеку, що Гоа'улди з'явилися за Дітьми Бога, носіями для сімбіотов. Побачивши Кулю, Даніел хотів кинутися до дружини, але в нього з обох сторін вчепилися Саманта і Джек. Тіл'к щось крикнув на мові Гоа'улдов, Джаффа підбігли до бранцями і змусили їх стати на коліна перед Апофісом. Гоа'улди не поспішаючи рушили вздовж низки наляканих людей.

Перший Дитя Бога обраний! Джаффа повели плаче дівчину. Хто стане наступним? І тут Даніел, немов божевільний, кинувся до Гоа'улду, що підбирає другого носія. (Він вирішив, що єдиний спосіб возз'єднатися з Кулі - стати носієм). Джек і Саманта не встигли його зупинити. Гоа'улд задумався над пропозицією Даніела, але вибрав не його, а Скаар. Другий раз О'Нілл втратив свого юного друга. Коли Джаффа повели обраних, Апофіс наказав Воїнам Змії вбити інших бранців. Побачивши націлені на них енергетичні жердини, в'язні в паніці кинулися врозтіч. Тільки О'Нілл, Даніел і Саманта не зрушили з місця. Єдина надія на порятунок - Тіл'к. Тіл'к за допомогою О'Нілла знешкодив охорону, парою енергетичних ударів пробив пролом в стіні. Налякані бранці, відчувши запах свободи, кинулися до Брами, О'Нілл, Даніел, Кратер і Тіл'к вирушили слідом за ними.

На базі майор Самуельс повідомив генералу Хеммонд, що в розпорядженні СГ-1 і СГ-2 залишилося менше години. «За годину багато що може трапитися, майор» - Хеммонд.

По дорозі до Брами Тіл'к показав личинку Гоа'улда у себе в животі, чим неабияк налякав Саманту і Даніела, і розповів, що в обмін на виношування личинки, він отримав довге життя і відмінне здоров'я, але видалення личинки призведе до смерті.

Над головами колишніх бранців пролетів гоа'улдовскій корабель, він переніс Скаар, Апофіса і інших Гоа'улдов до Зоряним Брами. На зворотному шляху корабель помітив утікачів і почав по них стріляти, але сам став мішенню і звернувся в вогненна куля, завдяки влучному пострілу СГ-2. Апофіс набрав координати і разом з Кулі зник в енергетичному тунелі, кинувши байдужий погляд на димлячі останки корабля. О'Нілл кинувся до Брами, щоб зупинити Скаар, але той зневажливо посміхнувся полковнику, блиснувши золотими очима, і відкинув Джека наручним пристроєм. Впавши на землю, приголомшений О'Нілл побачив, як його друг зник в просторовому тунелі.

На базі майор Самуельс повідомив генералу Хеммонд, що час, відведений СГ-1 і СГ-2, минув, і необхідно блокувати Врата, але Хеммонд зволікає.

На Чулаки Уоррен і Кейсі (із загону СГ-2) зі своєї позиції на пагорбі помітили наближається загін Воїнів Змії. О'Нілл наказав Саманте допомогти Даніелу набрати координати і повернутися на базу, щоб попередити генерала Хеммонд про прибуття біженців. Даніел, кинувшись було до пристрою набору, раптом пригальмував і став гарячково шукати записку з координатами Землі. Загін Воїнів Змії дістався до притулку Уоррена і Кейсі, зав'язалася перестрілка.

На базі генерал Хеммонд віддав наказ запечатати Врата і анулювати коди СГ-1 і СГ-2.

На Чулаки Даніел все ще шукає записку з координатами Землі, О'Нілл зі зростаючим занепокоєнням спостерігає за ним. Нарешті, записка знайшлася, і Даніел набрав перший символ. О'Нілл і Тіл'к зайняли позицію за кам'яними колонами, Кавальскій наказав Уоррену і Кейсі відступати до Брами. Даніел набрав останній символ, Картер передала секретний код - прохід відкритий.

На базі Самуельс повідомив генералу Хеммонд, що хтось активував Врата з іншого боку і передав код СГ-1. Хеммонд наказав відкрити діафрагму.

На Чулаки Уоррен і Кейсі під щільним вогнем Воїнів Змії перебралися до Брами. Картер з першими двома біженцями стрибнула в тунель, Даніел зайнявся іншими.

На базі Картер попередила генерала Хеммонд про біженців.

На Чулаки Кавальскій, Тіл'к і О'Нілл з останніх сил відбивають удари Джаффа, які повільно, але вірно наступають. Деякі з біженців поранені. Коли останній біженець минув Врата, полковник О'Нілл наказав Даніелу повертатися на базу. Даніел неохоче попрямував до Брами.

На базі з тривогою чекають появи інших членів СГ-1 і СГ-2.

На Чулаки залишилися члени СГ команд почали відступати під натиском противника. Кейсі поранили пострілом з жердини, Кавальскій і О'Нілл поволокли його до Брами. Один Джаффа занадто близько підібрався в Брами, але Тіл'к розправився з ним. Інший Джаффа спробував заволодіти пристроєм набору, але на нього накинувся несподівано з'явився високий довговолосий чоловік. Кейсі спіткнувся і впав. О'Нілла відволік третій нападник. Довговолосий чоловік кинув мертве тіло Джаффа поруч з Кейсі. Коли Кавальскій нахилився, щоб допомогти Кейсі встати, маленький Гоа'улд вискочив з сумки мертвого Джаффа і застрибнув у вухо Кавальскому. О'Нілл і Кавальскій підхопили Кейсі і стрибнули в тунель слідом за Тіл'ком і довговолосих. Джаффа оточили Зоряні Врата.

Коли О'Нілл, Кавальскій і Кейсі прибутку на базу, діафрагма зачинилися прямо перед носом Джаффа, кинулися за ними в погоню. Тіл'к своєю появою викликав на базі переполох. Усвідомивши, що небезпека позаду, біженці почали радісно дякувати СГ-1 і Сг-2. Медики зайнялися пораненими. О'Нілл звернувся до Хеммонд з проханням, включити Тіл'к до складу СГ-1. Всі зайняті, і ніхто не помітив, як очі Кавальского спалахнули біло-золотавим світлом.